MDC組織目前分四個層面、六個等級，如圖所示：縱方向為層面、橫方向為等級。同一層面表示具有同一性質特性的體系、橫方向同一高度代表具有相同的等級，例如直屬站長官、分區長官、同盟站站長、板主聯席會會長都具有MDC大員的身分與職權。

二、各職權說明：

　　D1.MDC最高當局(安國寺)：統籌MDC所有活動，包括MDC半年刊、MDC大會的舉辦、對外團體的外交、維護MDC版權不受侵犯、協調其下各單位之運作、為MDC吸收人才、協調網友間糾紛、維持組織穩定。

　　B2.糞金龜管理者(Alpha、SHR)：糞金龜空間軟硬體維護及管理者，擁有對糞金龜空間利用管理的權力，綜合論壇發展的最高指導。

　　C2.MDC製作總監(Capatin Picard、安國寺)：直接管轄MDC本站的網站業務；負責網站發展；負責督促各分區、各直屬站發展、維護MDC網頁版權不受侵犯。

　　A3.綜合論壇板主聯席會會長(安國寺)：負責綜合論壇板主聯席會的運作；接受決策案、懲戒案的提報；表決的召開。

　　C3-1.直屬站站長或製作總監：負責直屬站的網站管理與發展。
　

　　C3-2.MDC主站分區長官：負責主站各分區網頁的管理與發展。沒有負責長官的分區由MDC製作總監直接管轄。

　　C3-3.MDC一級同盟網站長官：MDC一級同盟網站的長官， 一級同盟站為與MDC關係最為密切的網站群，站長常在MDC活躍、貢獻、積極參與MDC事務，定義與首頁連結網際盟友站不同(該定義為網際盟友，與MDC平行，不過不參與MDC事務)。一級同盟站與MDC亦無直接從屬關係，不過 站長具有MDC大員身分。　

　　D3-1.MDC大員會議：MDC重要決策決定議會。

　　D3-2.MDC各分會長官(香港分會-Slava)：MDC各分會指導發展以及與本部之間的聯繫。

　　A4.綜合論壇板主群(參考論壇內容)：管理綜合論壇各分板，吸收人才與精華文章。

　　C4.各直屬分站副站長以及製作委員(參考各分站內容)：負責各直屬站之建設。

　　C5.自由作者：為MDC不定期貢獻文章或網頁的網友。

　　A6.綜合論壇註冊成員：於綜合論壇註冊的成員。

　　D6.一般成員：除於綜合論壇註冊成員外有參與MDC各項活動者，如參加大會者、參加各分會者、參加各結盟團體者，為廣義的MDC成員。